Sobre a iluminação podes sempre ver na secção DIY o que poderás fazer para o teu caso.
5 dias não me parece muito, principalmente para o tipo de plantas que são, muito mais estão elas às vezes nas lojas para venda.
Sim devem ser as caixas que eu penso, primeiro podes tentar lavar as que tens, passas por água do aquário (quando fizeres uma TPA colocas parte da água num recipiente e lavas lá o melhor que poderes), verifica dentro da biobox se tem lixo que possa ser aspirado e em tubos ou algo similar se tem sujidade que obstrua a passagem de água.
Agora as 4 caixas, segundo penso são esponja azul, lâ branca, umas coisas castanhas (tipo leca) e uma esponja preta, que é carvão activo, essa podes retirar e colocares ou outra esponja azul ou leca. A esponja preta podes colocar quando tiveres feito algum tratamento e precises retirar restos de medicamento.