Nesse caso julgo que o problema não é só poder rebentar, pois se a videira ainda tem seiva, é sinal que a vai largar para algum lado o julgo (sem certezas) que a seiva não seria muito benéfica para o bom funcionamento do aqua.
Quanto a isto não sei dar certezas, mas julgo não haver nada de mal...
Se meteres a 1ª vez o tronco absorve o sal na mesma, indo de seguida liberta-lo na mesma no aqua, quanto às bactérias, se ferveres o tronco e de seguida o colocares num balde com água e gelo (mudanças rápidas de temperatura seja de frio para quente, seja de quente para frio), não devem ficar muitas bactérias para contar a história
Abraço