TPAs servem apenas para reduzir/dissolver elementos indesejáveis presentes na água no aquário. Mas havendo outro método de as remover, não é de todo necessário fazer TPAs. Atingindo um equilíbrio biológico dentro do aquário, e possível deixar de fazer TPAs completamente, e isso vê-se bastante no hobby da água salgada, em que se falar algumas vezes em aquários que já não fazem uma TPA há décadas.
Eu mantive um aquario de água salgada e utilizei um método (método Triton) que me permitiu manter o aquário com sucesso durante cerca de 1 ano com apenas 1 TPA (podia ter durado mais, mas vou mudar de país em breve e tive que vender tudo). O maior truque deste método é ter um filtro Sump com uma secção só para ter algas que absorvam os elementos indesejados (por exemplo Nitratos e Fosfatos). Retirando parte destas algas, estamos no fundo a retirar o que elas absorveram da água, e já não será necessario fazê-lo através de TPAs.
O problema principal de quem quer deixar de fazer TPAs é que se olha muito apenas para os parâmetros que conseguimos medir em casa, mas há muitos parâmetros que só se conseguem medir em laboratório. O método Triton de que falei permite-nos enviar água do aquário para ser testada em laboratório sempre que desejarmos (idealmente 1 vez por mês).
Também já consegui com um aquário de água doce de 20L, em que não fiz uma única TPA durante 6 meses. Era densamente plantado com fertilizante feito por mim, camarões, blackworms, pulgas de água, vários tipos de caracóis, tudo para manter as coisas "limpas", e apenas 1 Beta. Mas só consegui atingir esse ponto depois de 1 ano e tal de ter o aquário a funcionar (e posso dizer que tive alguma sorte á mistura).
Muitos sistemas de Hidroponia com peixes também seguem este sistema, utilizam os peixes para produzir "fertilizante", que é absorvido pelas plantas e a água só é reposta quando evapora, sem detrimento para os peixes.