Um aquário não é susposto ser um ambiente asséptico, completamente desinfectado e apenas com alguns peixes. Possui toda uma fauna de pequenas dimensões, a começar pelas bactérias e a acabar por vezes em pequenos seres como estes que descreves.
Dizes serem planárias, mas pela descrição parecem me mais ser pequenos anelídeos, que costumam surgir em aquários com excesso de restos de alimentos no areão. Não são prejudiciais, antes pelo contrário, são benéficos pois eliminam os restos de comida e são indicadores que a pessoa que trata do aquário necessita de mudar os seus hábitos e neste caso, dar menos comida, aumentar a filtragem, aspirar o areão, etc. Experimenta fazer uma destas coisas, em vez de estar a colocar um químico na água para matar a bicharada.
Fica a sugestão.
Cumprimentos e boa sorte!