Boas, antes de mais bem vindo ao forum!
se necessitas de substrato fertil ou n isso depende do tipo de plantas que pretendas colocar e das suas exigencias
com o aqua ja montado é meio complicado estares a colocar substrato fertil, até pq normalmente este deve estar por baixo do areao normal, se calhar o melhor era refazeres a coisa
quanto ao filtro de fundo aconselhava-te a trocares por um filtro externo, so tens vantagens nisso.
abraço
William