Boas João!
Ainda não tinha tido oportunidade de comentar, mas tenho seguido o teu trabalho. Até porque é bastante similar ao meu. Está muito bom parabéns!
Relativamente ao problema que tiveste, infelizmente tive o mesmo. No inicio, três dos meus amanos saltaram, todos na mesma noite. Também como tu, tinha os parâmetros todos impecáveis. Após muitas pesquisas vim a descobrir que, uma das teorias, é a redução abrupta da luz. A redução abrupta da luz causa um stress imenso nos peixes e, sem querer, acabam por saltar fora... Acredito que possa ter sido o caso.
Descobri esta info num video do Luis Oliveira https://www.youtube.com/watch?v=LB_lLFmO1b0&t=618s
Relativamente ao skimmer, porque não optas por um inflow com skimmer?
Abraço!