Para analisar melhor a situação, talvez fosse bom saber à quanto tempo tens o aquário montado.
Pela descrição cheira-me a pico de amónia (quer por falta de maturação do aquário ou manutenção a nível de filtro)
Não sei se usas filtro externo, mas se tiveres tens carvão activo lá dentro? Se sim, há quanto tempo?
O carvão absorve todos os contaminantes da água e medicamentos mas convém ter cuidado pois quando ficar saturado manda tudo de uma vez de volta para o aquário.