Eu vou dar a minha opinião, mas aviso que não percebo nada de trabalho manuais:
Essa prateleira que está aí apenas (e eventualmente) poderá evitar que a lateral do armário entorte para fora e possa em útimo caso partir com a torção.
Os travamentos dos armários são normalmente feitos pelas costas dos mesmos. Mas pela foto esse armário não tem costas (algo que eu teria colocado para suportar um peso desses).
Na minha humilde e simples opinião podes colocar a prateleira mais em cima e depois retirar essa ou fazer um recorte em U, o que te mantém as laterais unidas a meio da altura do armário mas apenas na zona das costas.
Se o espaço der, mesmo que o filtro só para entrar e sair tenha que ser inclinado, eu colocaria uma prateleira mais acima e essa não cortaria em U mas sim em O (não sei fazer aqui um quadrado que também serve) deixando uma moldura a toda a volta com cerca de 2 cm.