Se fosse eu, faria como disse o Henrique, mas apenas com uma pequena diferença...
Depois de retirares a água para um outro recipiente, colocar filtro, termostato, peixes e fazer todas as alterações, enchia o aquário com "água nova", retirava-a praticamente toda depois de repousar uma meia hora e só depois introduzia a água do recipiente e os peixes.
Isto porque ao mexeres o areão vais ter muita amónia a circular.
Encher e esvaziar novamente vais retirar grande parte dessa amónia.
Depois de recolocares tudo faz o teste de amónia e se necessário faz uma nova TPA de cerca de 50%.
Abraço