Boa noite, há já algum tempo que não vinha aqui mas então vou tentar tirar-te algumas dessas dúvidas..
Então comecemos pelo início... essas pedras de mar que tens espero que não sejam mesmo vindas do mar (o sal que contêm é prejudicial para a saúde dos peixes). Os guppys dão-se bem com qualquer tipo de areão, mas evita aqueles com muitas cores pois isso baralha os peixes.
Não tem mal não teres plantas naturais, caso as tenhas (mas é preciso iluminação) elas ajudam na saúde dos peixes.
Todos os peixes gostam de ter um pouco de iluminação, é melhor para eles e tanto para ti para os veres (há aquelas lampadas baratas que compras nos chineses, já ajuda qualquer coisa)
Como o filtro teve muito tempo parado, deves mudar o carvão sim, meter um novo e se tiveres, umas esponjas novas.
A ciclagem deve ser feita já com a temperatura da água a que vais meter os novos habitantes... por isso penso que devias fazer uma nova ciclagem mas com a água à temperatura ideal para os guppys, visto que podem aparecer doenças relativas a isso..
Mas mais alguns 'peritos' vão ajudar-te neste tópico, qualquer coisa já sabes