Sinceramente acho que esse aquário é muito pequeno para tropheus.
Com um fundo DIY, vais ficar ainda com menos espaço dentro do aquário, ou seja, ainda menos água.
A estrutura que falas em não conheço, mas pela tua descrição dá na boa!
Quanto à filtragem arranjas um bom filtro exterior e uma powerhead ou um filtro interno para fazer circular (ainda mais) a água.
Escolheste uma especie que requer alguns cuidados especiais, tanto a nivel de parametros da água, alimentação, combinação de especies, etc.
Atira-te de cabeça, mas tens que saber onde vais aterrar :D
Cumps
Pedro Figueiredo