O problema está aqui. Tens um filtro pequeno logo esponjas pequenas, ao lavá-las mesmo que seja na água do aquário muita da flora bacteriana vai ser destruída pelo processo mecânico da lavagem, restando muito poucas bactérias.
Agora é importante monitorizares os níveis para não por a vida dos peixes em risco.
Aproveito também para te aconselhar a mudar as esponjas por um saco de SERA siporax mini (p. exemplo), pois é ai que vão estar as bactérias para fazer a filtração biologica e deixas uma esponja (não preta que essas são de carvão activo, podes comprar uma azul e cortar a medida) para fazer a filtração mecânica.
Depois já podes lavar a esponja sem te preocupares em matar a colónia pois ela já vai estar em força nas cerâmicas. Sendo que nesta não deves lavar.