Se puderes usar os 2 filtros é melhor, como é obvio. Se tiveres os 2 montados com vários tipos de filtragem, funciona. Se tiveres um só com filtragem mecânica e outro com biológica, funciona.
Basicamente é uma questão do trabalho que se quer ter com o aquário... Com 2 filtros idênticos na filtragem, podes intercalar a limpeza entre eles, com filtragens diferentes, limpas mais vezes o que tem a filtragem mecanica.
Na colocação das matérias filtrantes, convém veres por onde é que a água circula dentro do filtro e depois colocares as matérias filtrantes, pela ordem da dimensão dos buracos da passagem de água. Começando sempre no que permite uma maior passagem da água para o menos e no fim a filtragem quimica.
No teu caso e pelo que mostras na foto, eu nesse filtro que leva os 6 cestos colocava as bioballs no 1º cesto por onde passa a água, esponja no 2º, ceramicas porosas no 3º e no 4º (as que mostras na foto, não percebo se são porosas ou não), lã filtrante no 5º e no último as bolas anti-amónia.
No da Tetra que estás a pensar colocar?