Dunkz, isso é muito esquisito, não é só stress...
Estou a meio duma criação e assim que tirei a fêmea, ela continuo como se nada fosse no outro aqua. O macho, esse sim ficou deprimido durante uns dias, mas acho que nos machos é normal. Convém quando mudes de aquário que seja para água com caracteristicas iguais e temperaturas iguais, para não haver nenhum choque.
De resto mesmo com algum stress, o betta é um peixe que aguenta relativamente bem.
Posso-te dar um exemplo, recebi uma fêmea vinda do porto, por transportadora, alguns dias depois dei-a a um membro de um outro forum, enviada por correio verde e ela anda bem, está viva. Aí no teu caso tem de haver outra coisa qq.