Desculpem a intromissão, mas definitivamente a água amarela é por causa dos troncos. Como alguém já disse libertam taninos e até ácidos húmicos. Esta água tende a ser ácida, normalmente boa para discus, acautelando os restantes parâmetros.
Só uma dica, quando coloco os troncos em água a ferver, deito sempre +- 4 colheres de sopa de sal, numa panela de 10 a 15 litros. Deixo também levantar fervura 3 a 4 vezes.
Mas esta operação só é feita depois de deixar os troncos em água durante pelo menos 15 dias, de preferência com mudanças de água diárias.
Na situação em causa, concordo que resolves com tpa's e algum tempo para os troncos "secarem" os taninos e os ácidos.
Um abraço a todos