Boas,
Pelo que pesquisei, os Medaka suportam temperaturas até 24ºC, um pH de 7,0 a 8,0 e atingem 4 cms no máximo, para além de serem pacíficos.
Sendo assim não vejo inconveniente em pores guppys.
Não recomeces o ciclo: mantém a massas filtrantes como estão pois já terão algumas bactérias boas. Mas espera mais um pouco até introduzires os guppys. Não te esqueças das TPAs de 2 em 2 dias durante mais uns 15 dias para completer o ciclo.
Cumps.