JocaAlex

É complicado dar sugestões quando não conhecemos o substrato...
Se esse substrato libertar amónia, à partida uma semana é sempre cedo para colocar peixes... e as plantas chegaram uma semana atrasadas.
Que espécie de peixes são? Tens aí àgua de garrafão para TPA de emergência?
Se a água esteve limpa uma semana o problema não é o inerte não o segurar, foi mesmo a forma como colocaste as plantas que levantou o substrato. Utiliza sempre pinça e sim, coloca mais um pouco de inerte em cima mas nada muito pesado ou minúsculo, é preferível colocar mais quantidade de um substrato leve (género akadama ou manado) do que gravilha de rocha.
Mantém o filtro sempre ligado senão a ciclagem vai ficar suspensa, podes é colocar uma esponja adicional como primeira barreira de forma a que possas limpar regularmente sem que os detritos entupam as matérias filtrantes importantes.
No saco os peixes vão acabar por sucumbir em pouco tempo, se não tiveres onde os colocar liberta-os no aqua, não acredito que morram, o substrato não é tóxico.