Algures disseste que davas 1 pastilha de comida, por dia, mais os restos da comida que os neons e os guppies não comem?!
Se percebi bem, penso que o teu problema podera estar no excesso de comida. Com o excesso de comida acabas por ter a água mais carregada de nitratos e portanto mais toxica.
Se percebi mal a questão da comida, julgo que de qualquer forma, so teres feito a primeira TPA ao fim de 3 semanas do aquário, é incorrecto, ja que e aconselhado que nos primeiros dias dos aquários, se façam pequenas trocas de água com bastante frequência. Eu comecei o meu aquário a cerca de 2 meses, e para além de ter feito ciclagem com alguma calma, num aquário carregado de plantas, trocava 20% da agua duas vezes por semana.
Aconselhava-te para já, a tentares mudar 15 litros de água a cada dois dias, e a dar comida as corydoras apenas 1 pastilhas de 2 em 2 dias. Eu tenho 4 corydoras, e as minhas comem meia pastilha da Nutrafin a cada 2 dias, mas acabam por comer algum granulado que caia no fundo do aquário, pelo que não passam fome. Há também aquela máxima, que mais facilmente os peixes morrem de excesso de comida, que de falta dela.